Martin Stoll recherchierte bis 2023 schwerpunktmässig zur Bundesverwaltung. Er ist Initiant und Geschäftsführer der Transparenzplattform Öffentlichkeitsgesetz.ch, bildet als Recherchetrainer Medienschaffende aus und ist Vorstandsmitglied des Schweizer Recherchenetzwerks investigativ.ch. Mit verschiedenen Recherchen stiess er parlamentarische Untersuchungen an. So deckte er eine geheime Connection des Schweizer Geheimdienstes zum damaligen Apartheidstaat Südafrika auf und machte ebenfalls im Geheimdienst ein folgenreiches Datenleck bekannt. Er war an Recherchen beteiligt, die den Rücktritt des ehemaligen Armeechefs Roland Nef und des Schweizer Botschafters in den USA, Carlo Jagmetti, zur Folge hatten. Für seine journalistischen Arbeiten wurde er wiederholt ausgezeichnet, unter anderem mit dem Zürcher Journalistenpreis. Seine jahrelangen Verdienste um die Entwicklung der Verwaltungstransparenz in der Schweiz ehrte das Branchenmagazin «Schweizer Journalist» 2019 mit einem Sonderpreis.
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